Über uns
Der Fokus der CUCA liegt auf der Identifizierung und Charakterisierung von proteomischen und genomischen Biomarkern. Verschiedene Tumorentitäten werden untersucht, um differentiell exprimierte Gene und Proteine zu identifizieren. Die dabei gefundenen Biomarker werden anschließend hinsichtlich ihrer biologischen Funktion charakterisiert. Folgende Techniken werden dafür eingesetzt:
- Laser-basierte Mikrodissektion zur Aufreinigung des Ausgangsmaterials (zum Beispiel Tumorzellen und gesundes Gewebe)
- DNA Micro Arrays (Agilent und Miltenyi Memorec) für die Expressionsanalyse auf mRNA-Ebene und "Mapping" Arrays für CGH- oder CNV-Analysen
- ProteinChip Arrays (SELDI) und 2-dimensionale Gelelektrophorse (2-DE) zur Analyse und Identifizierung der proteomischen Unterschiede komplexer biologischer Proben (Zellen, Gewebe, Körperflüssigkeiten)
- MALDI-Imaging erlaubt es, Proteine und Peptide, aber auch
Wirkstoffe und deren Metabolite in Gewebeschnitten über ihre Massensignale
zu lokalisieren.
Für diese Arbeitsziele stehen ein Laser-Mikrodissektionssystem (ZEISS/PALM Microbeam C), ein PCS 4000 SELDI-Massenspektrometer (Biorad) und eine Agilent DNA-Array Plattform zur Verfügung.
Die CUCA zählt weltweit zu einer der wenigen Gruppen, die in ihren Profiling-Studien Mikrodissektion und Massenspektrometrie kombinieren.